1、理财通和余额宝都可以利用手机操作，操作起来也是比较方便。余额宝在刚推出阶段收益是比较高，但现在下降了许多，每天的收益率是一样的，而理财通的收益率每天都不一样。

2、安全性上，实在讲理财通要胜余额宝一筹，不过这种安全性是以牺牲便利性为前提的。余额宝不但绑定理财，还绑定了支付，一旦账号安保被攻破，就可以轻易损失。而理财通只能关联固定的银行账号，无法直接用于交易。这一点上，就看你的需求了。如果从便利性出发，余额宝肯定好用，如果从安全性出发，理财通会好一些。

3、购买门槛不同：

微信理财通：1元起购。

余额宝：1分起购。门槛更低。

余额宝和微信理财通相比较的话，余额宝的收益情况比理财通多，但是理财通依靠于微信这一使用率广泛的聊天软件，受到很多人的好评，但是具体选择哪一个还是要靠自己来决定。

4、微信理财通是在做货币基金的销售平台，腾讯微信只是提供平台，至于理财通中的产品可以说是想上哪个上哪个，理财通有推荐的权利。而余额宝则是和天弘基金绑定的，用户在使用过程中甚至感受不到天弘基金的存在。

5、微信理财通在安全方面可谓做足的功夫，推出安全卡的概念，就是你可以绑定很多个银行卡，其中一个设定为安全，理财通的钱只能从安全卡里出，最后也只能回到安全卡，不可以用于支付。很明显，这个设置是针对余额宝的，因为余额宝中的钱是可以直接支付的，这也是很多人觉得余额宝不安全的一点。另外余额宝是集成到支付宝中的，在手机上使用支付宝是需要登录支付宝的，但微信在手机中是可以直接打开的。理财通和余额宝都设置了手机支付密码。